5回目のワクチンの接種を別のプロバイダにお願いしたところ、別の公開鍵で署名された別の接種証明書をいただきました。検証する側は複数の証明書を検証する必要がありそうです。
https://zenn.dev/zunda/articles/53ca4d514c1a4d#%E7%95%B0%E3%81%AA%E3%82%8B%E3%83%97%E3%83%AD%E3%83%90%E3%82%A4%E3%83%80%E3%81%AB%E3%82%88%E3%82%8Bsmart-health-card%E3%81%AE%E8%A7%A3%E9%87%88%E3%81%A8%E6%A4%9C%E8%A8%BC
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